El notocordi és una estructura cel·lular en forma de vareta, recoberta per una beina fibrosa que actua com a eix esquelètic intern.
 
Figura 4.- Fotografia i esquema d'un amfioxus on s'observa la posició del notocordi. Fotografia i dibuix de Biodidac.
 
Es situa entre el tub neural, més dorsal, i el tub digestiu. En algunes formes es manté al llarg de tota la vida de l'animal (com en l'amfioxus) però en altres només ho fa durant l'etapa embrionària.
 
Figura 5.- Imatge d'una larva d'ascidiaci (procordat) amb el notocordi ben desenvolupat però que desapareix en l'etapa adulta. Fotografia de Biodidac.
 

El notocordi és la primera estructura esquelètica que apareix en l'embrió dels cordats i serveix per a la inserció de la musculatura. Aquesta musculatura, combinada amb l'estructura del notocordi permet que el cos adopti moviments ondulatoris.

El notocordi pot acompanyar o ser substituit per un endoesquelet cartilaginós o ossi el qual els ha permès créixer de manera continuada, sense mudes, i per tant aconseguir talles considerables ja que és minimitza el pes d'aquesta estructura.

En els vertebrats es formen una sèrie de vertebres òssies o cartilaginoses al costat del notocordi i que acaben per substituir-la.