El claustro es la pieza noble del monasterio. Se construyó entre los años 1465 y 1494. Es una obra fina, delicada y monumental. Las columnas son de arenisca (piedra de Montjuic) y las columnas centrales son de caliza nummulítica (piedra de Girona). Las bóvedas representan santos, escenas bíblicas... y están hechas con piedra de Montjuic (arenisca).
El surtidor del patio está decorado con escudos de obispos y benefactores del monasterio. El surtidor es de piedra de Montjuic. El otro surtidor, el más grande, procede de un monasterio que había cerca de la rambla de Santa Mónica en Barcelona y, también, está hecho con piedra de Montjuic aunque el grano de esta arenisca es más gordo.
Los Reyes Católicos, Isabel y Fernando sufragaron los gastos de la construcción del ala oeste, por lo cual podamos ver los escudos de estos monarcas en las llaves de vuelta de las arcadas del techo, también hechos con piedra de Montjuic.