Existeixen unes 50.000 espècies de protozous i poden viure aïllats o formant colònies.

Flagel·lats

Molts són paràsits que produeixen malalties, algunes de elles molt greus.

Tricomoniasi (Trichomonas vaginalis)
Malaltia de Chagas (Tripanosoma cruzi)
Leishmaniosi - "Kala-azar" - (Leishmania donovani, L. mexicana, L. vianna)
Leptomoniasi
Tripanosomiasi - "Malaltia de la son" - (Tripanosoma gambiensis)
Giardiasi - "Lamblies" - (Giardia lamblia)

Ciliats

Es el grup més nombrós. La majoria viuen lliures en aigües dolces o marines. Uns pocs són paràsits de peixos i mamífers, fins i tot de l'home.

Balantidiasi (Balantidium coli)

Rizòpodes o sarcodins

Posseeixen pseudópodes per moure's i capturar l'aliment.

Amibiasi (Entamoeba histolytica)

Esporozous

Son tots paràsits. Es reprodueixen per espores resistents, i també sexualment, amb cicles molt complexes.

Malària. (Plasmodium vivax, P. malarie, P. falciparum, P. ovale)